滞纳金最高限额为本金的40%，超过8000元将收费。

针对您提出的问题，若合同约定的滞纳金超过了本金的40%但未达到8000元，这样的约定可能不合法。根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，约定的违约金（滞纳金）过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。这里的‘过分高于’通常理解为超过实际损失的百分之三十。因此，如果滞纳金超过本金损失的30%，可能被视为过高，法院有权调整。在本例中，若本金损失的30%低于约定的滞纳金比例但未达到8000元上限，该约定仍可能因过高而不被法律支持。
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从法律角度，合理的滞纳金（违约金）金额应不超过因违约行为给对方造成的实际损失的百分之三十。若双方对实际损失有争议，法院或仲裁机构会根据案件具体情况进行裁量。同时，若合同中有明确且合理的滞纳金上限约定，该上限也应作为法院或仲裁机构考量因素之一。
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若滞纳金既超过了本金的40%也超过了8000元，处理方案如下：1.根据《中华人民共和国民法典》规定，向法院或仲裁机构申请调整滞纳金至合理范围，即不超过实际损失的百分之三十；2.若合同中同时约定了不超过8000元的上限，法院或仲裁机构可能会综合考虑，将滞纳金调整至不超过本金损失的30%且不超过8000元的合理水平。